Abstract Protozoa of the Apicomplexa phylum are worldwide distributed with capacity to infect endothermic animals. The study of these protozoa in wild birds in Brazil is scarce. This study aimed to evaluate the occurrence of apicomplexan protozoa in wild birds in the Northeast of Brazil. From October to December 2019, brain tissue samples were collected from 71 captive birds from the Wild Animal Screening Center of the Pernambuco State (CETRAS-Tangara) and 25 free-living birds from the Caatinga biome in Rio Grande do Norte, totaling 96 animals (41 species). Brain fragments were subjected to molecular diagnosis by nested PCR for the 18s rDNA gene of Apicomplexa parasites, followed by DNA sequencing. This gene was detected in 25% (24/96) of the samples, and it was possible to perform DNA sequencing of 14 samples, confirming three genera: Isospora, Sarcocystis and Toxoplasma from eight bird species (Amazona aestiva, Coereba flaveola, Egretta thula, Paroaria dominicana, Sporophila nigricollis, Cariama cristata, Columbina talpacoti, Crypturellus parvirostris). The occurrence these coccidia in wild birds provides important epidemiological information for the adoption of preventive measures for its conservation. Future studies are needed to better understand the consequence of Apicomplexa infection in birds in Caatinga and Atlantic Forest biomes.

Resumo Protozoários do filo Apicomplexa são distribuídos mundialmente e com capacidade de infectar animais endotérmicos. O estudo destes protozoários, em aves silvestres do Brasil, é escasso. Objetivou-se avaliar a ocorrência de protozoários Apicomplexa em aves silvestres na região Nordeste do Brasil. De outubro a dezembro de 2019, foram coletadas amostras de encéfalo de 71 aves de cativeiro do Centro de Triagem e Reabilitação de Animais Silvestres de Pernambuco (CETRAS-Tangara). E 25 aves de vida livre do bioma Caatinga no Rio Grande do Norte, totalizando 96 animais (41 espécies). Os fragmentos de encéfalo foram submetidos ao diagnóstico molecular por nested PCR, para o gene 18s rDNA de protozoários Apicomplexa, seguido por sequenciamento do DNA. Este gene foi detectado em 25% (24/96) das amostras analisadas; foi possível realizar o sequenciamento de 14 amostras, confirmando-se três gêneros: Isospora, Sarcocystis e Toxoplasma em oito espécies de aves (Amazona aestiva, Coereba flaveola, Egretta thula, Paroaria dominicana, Sporophila nigricollis, Cariama cristata, Columbina talpacoti, Crypturellus parvirostris). A ocorrência destes coccídios nas aves silvestres fornece informações epidemiológicas importantes para a adoção de medidas preventivas tendo em vista sua conservação. Estudos futuros são necessários para melhor compreensão da consequência da infecção por Apicomplexa, em aves silvestres dos biomas Caatinga e Floresta Atlântica.